Program Studi pendidikan Biologi FKIP UMMI didirikan pada 3 Oktober 2006 dengan SK Ijin Penyelenggaraan Nomor: 3791/D/T/2006. Akreditasi terakhir menduduki peringkat B dengan SK BAN-PT Nomor:1262/SK/BAN-PT/Akred/S/XII/2015 dan berlaku s.d 29/12/2020, dan memperoleh perpanjangan secara otomatis berdasarkan SK Nomor: 180/SK/BAN-PT/Ak-Ppj/S/I/2021 30 Desember 2020 s.d 30 Desember 2025.
Lulusan program studi pendidikan biologi diarahkan menjadi tenaga pendidik biologi di boarding school dan sekolah alam, asisten peneliti biologi, dan wirausaha biologi yang menjunjung tinggi nilai-nilai keislaman untuk mengembangkan pendidikan di masa yang akan datang.